研究表明亚氯酸盐可导致高铁血红蛋白和溶血性贫血，并具有较强的致突变性，国际癌症研究中心已将亚氯酸盐列为致癌物，氯酸盐为中等毒性化合物，氯酸盐、亚氯酸盐会引起溶血性贫血，并降低精子的数量和活力。另外，还能影响肝功能和免疫反应，使得肝脏产生坏死病变，肾和心肌营养不良。

《生活饮用水卫生标准》中明确规定，在使用二氧化氯作为消毒剂时，必须对水中氯酸盐、亚氯酸盐进行常规监测，确保饮用水安全，同时要求所有生产企业加强生产工艺的控制。目前实验室主要采用的检测方法为离子色谱法，其为分析无机阴离子的有效方法，具有简单、快速、灵敏度高等优点，满足对生活饮用水中氯酸盐等阴离子的检测需要。